Je ne pense pas que les deux modes soit si incomparables qu'on voudrait le croire (au moins sur les "Grandes Lignes"), étant donné que les avions sont retardé en très grande majorité lorsqu'ils sont au sol.
Comme un train, un avion a besoin d'être préparé : nettoyage, catering, pleins de carburant. S'il n'est pas déjà au bon endroit, il faut qu'il soit tracté à son parking pour embarquer (comme un train serait mis à quai), puis montée de passagers à bord/chargement des soutes, sachant que ça peut trainer là aussi.
Une fois prêt au départ, l'affaire n'est pas forcément gagnée pour l'avion, sachant que tant qu'il est au sol, il ne peut pas non plus passer "par-dessus" les autres. C'est sans compter qu'à côté de ça, le trafic aérien est régulé en amont à l'échelle européenne (Eurocontrol) afin d'éviter que trop d'appareils se retrouvent dans un même secteur en même temps.
Bref, si on regarde la ponctualité au départ (gare/aéroport), ça ne me semble pas si insensé que ça comme comparaison.